水稻干尖線蟲病是典型的種傳病害，攜帶干尖線蟲的種子是該病的主要侵染途徑，灌溉水和土壤傳播的范圍小。因此防治上重點在于選好水稻品種和做好種子消毒處理。
第一，選擇無病蟲的水稻種子，禁止從病區(qū)調(diào)運種子，并加強對種子的檢疫，防止帶蟲的稻種流入生產(chǎn)；注意選用抗病蟲能力較強的品種。
第二，播種前對水稻種子藥劑處理是防治干尖線蟲病最有效的方法，一旦錯過這個時期，干尖線蟲侵入生長點后就難以用藥防治。藥劑浸種可選用噻唑膦、阿維菌素B2，其中用10%噻唑膦乳油100克/升浸種48小時，對干尖線蟲病的防效達到90%以上，連續(xù)多年浸種，水稻干尖線蟲病可完全控制，也可用殺螟.咪鮮胺、二硫氰基甲烷（的確靈）浸種。
第三，除用藥劑浸種外，還可采取溫水浸種，一種簡單而有效的方法。
